Cy5,146368-11-8磺基-CY5 羧酸荧光标记
中文名：Cy5
中文别名： 2-[5-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚内盐;2-[5-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚鎓内盐;磺酸基-CY5羧酸;磺基-CY5 羧酸
分子式：C33H40N2O8S2CAS：146368-11-8
外观：淡固体
分子量：656.81激发波长：620nm
发射波长：646nm溶解度：有机溶剂
质量控制：97.4%储存条件：-20℃
保存时间：1年
产品简介； 花菁染料及其衍生物，常被应用于生物分子标记，荧光成像及其他荧光生物分析。它们用于标记多肽、和核酸等。Cy3花菁染料与结合荧光。
结构式如下：
Cy5,146368-11-8磺基-CY5 羧酸荧光标记
产品描述：
花氰染料cy5,常被应用于生物分子标记,荧光成像及其他荧光生物分析。Cy5（磺基菁5）是一种活性染料，用于标记肽、和寡核苷酸中的氨基。这种染料需要少量的有机共溶剂（如DMF或DMSO）用于标记反应。该试剂适合于对可溶性以及肽和寡核苷酸进行经济的标记。该试剂也适用于有机溶剂中的小分子标记。激发（nm）：649，发射（nm）：670。Cy5 NHS ester 是用于标记肽、和核苷酸中的氨基的活性染料。这种染料需要少量的有机共溶剂（如DMF或DMSO）用于标记反应。该试剂是可贵的标记的可溶性蛋白以及肽和核苷酸的试剂。该试剂也适用于小分子标记的有机溶剂。对于更复杂的目标，如易降解的，当使用DMF或DMSO是不可取的，考虑使用水溶性Cy5 NHS ester，它不需要共溶剂，并且具有相似的荧光性质。
注意事项：为了的溶解.请将管在37℃加热并在声波浴中摇晃一段时间，菁染料Cy3 和Cy5 已成为基因芯片的荧光标记物; 另外,Cy5, Cy5.5 和Cy7 的吸收在近红外区背景低，是荧光强度、稳定的长波长染料
CY花菁染料的特点：
1：菁染料的摩尔吸光系数在荧光染料中高的
2：细胞和的自发荧光在近红外波段较小
3：更高的性和灵敏度
4：光波在近红外区段的透过性
CY花菁染料的缺点
1：菁染料的荧光量子效率相比其他染料较低，一般是0.1-0.2
2：多川结构的菁染料容易发生聚集
Cy5荧光染料:能发出荧光的染料。 Cy2、Cy3、Cy5 和Cy7。上述青色素均可以通过其反应基团与核酸或蛋白相连。例如，采用了蛋白标记的马来酰亚胺基团。有趣的是，对于荧光，Cy5 对其周边电子环境敏感，该特征可用于酶测定。附着的构象改变会导致荧光发射产生阳性或阴性变化。
Cy5荧光染料:能发出荧光的染料。 Cy2、Cy3、Cy5 和Cy7。上述青色素均可以通过其反应基团与核酸或蛋白相连。例如，采用了蛋白标记的马来酰亚胺基团。有趣的是，对于荧光，Cy5 对其周边电子环境敏感，该特征可用于酶测定。附着的构象改变会导致荧光发射产生阳性或阴性变化。此外，Cy3 和 Cy5 还可用于 FRET 试验。青色素染料是一种相对较老的荧光染料，但却是其他荧光染料在亮度、耐光性、量子产率等方面得以的基础。在吸收紫外线或可见光后，能把短波长的光转变为波长较长的可见光波而反射出来，呈闪亮的鲜艳色彩。例如，酸性曙红、荧光黄、红汞以及某些分散染料等。它们大多是含有苯环或杂环并带有共轭双键的化合物。Cy5荧光染料可以单独使用，也可以组合成复合荧光染料使用。其中复合荧光染料是利用荧光共振能量转移合成的荧光染料，由距离近、能量可以在彼此间传递的一个供体及一个受体荧光物分子所组成。复合染料在受体分子的激发波长被激发，在供体分子的发射波长发射一个光子。荧光染料发展迅速，已研究的用于科研和临床应用的荧光染料已基本覆盖了由紫外到可见光及红外的整个光谱范围。
cy5荧光染料有异构化的特点。有以下四大特点：
1）其标记的抗体适用于配备633nm氩离子激光器的流式细胞仪；
2）FL4通道检测；
3）小分子染料，适合需小分子染料的流式细胞术，荧光强度低于APC。
4）与单核和粒细胞非性结合多，易出现假阳性结果。
Invitrogen Cy5染料是一种明亮的远红色荧光染料，其激发适合633 nm或647 nm激光线。与其他荧光团相比，使用长波长染料（如Cy5染料或Invitrogen Alexa Fluor 647染料）的一个特点是该光谱区域内生物样本的自发荧光较低。
Cy5荧光团也是亲脂性元和DiD细胞追踪试剂的基础，该试剂添加烷基尾部(≥12个碳）添加到荧光团上。
对于稳定的信号产生，Alexa Fluor 647染料在和核酸结合物中通常比Cy5染料更亮。别藻蓝蛋白（APC）是另一种明亮的荧光团，其光谱相当于Cy5染料和Alexa Fluor 647染料，但它几乎用于流式细胞术。
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