产品介绍：

最短的时间内获得答案，智能化的工作流程，广泛的测序应用范围     

 Illumina公司推出的MiSeq是目前一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪，每次运行能产生超过1 Gb的数据，且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq有着革命性的流程和的准确性，这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台，适合广泛的应用。同时根据Illumina的消息，今年9月份左右，MiSeq系统的测序通量将会升级至7G左右。升级将通过两个方面完成，一个是cluster密度的增大，升级后cluster密度将会增加至12-15million，而pair-end读取的reads数目将会增加至24-30million；另一方面是通过测序读长而提升通量，届时测序读长会达到2*250bp，同时测序速度也会有所提升。目前，Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长，Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些，都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。

MiSeq性能参数

 1.技术规格

▲1.1高数据通量：每轮反应可生成15G的有效数据；通量可以根据不同要求调整；

1.2每次运行可生成可读2500万个测序片段标签序列；

1.3每轮实验运行成本：测序150亿（15G）个碱基对所需成本不高于2000美元；成本包含了从样本前期建库-克隆扩增-测序-数据分析的所有成本；

▲1.4有效数据读长：单端读取序列，读长可达300个碱基；双端读取序列：读长可达2x300个碱基 。读长可根据不同的应用而调整；

▲ 1.5 拼接前原始数据质量评判采用的测序质量标准为Q30，并且高于Q30的碱基比例是整个运行的平均结果；

▲1.6实验流程:样本文库制备只需要90分钟。之后在同一系统中直接开展自动克隆扩增－测序－数据分析。整个过程不需要繁琐的emulsion 实验，人工干预的时间少于1小时；

▲1.7无需单独的扩增设备，所有样本的克隆扩增, 测序到数据分析都在同一台仪器中自动完成，无需人工干预；

1.8 多重扩增子测序的每次反应最多可同时检测384个样本，每个样本可同时分析1536条产物。可根据不同实验需要选择样本通量；

1.9 厂家能够提供商品化的应用试剂供用户日常选择使用，比如：

     检测自闭症的试剂；

     检测靶向主要是针对生殖细胞存在的与肿瘤相关基因的试剂；

     检测遗传性疾病的试剂，能够重点关注婴幼儿早期严重的、隐形遗传病；

  1.10 仪器具备以下软件分析功能：

•      全基因组重测序

•      定向重测序，包括但不限于下列方法：

o     TruSeq 自定义捕获

o     TruSeq 自定义扩增子测序

o     长距离片段

o     分子倒置探针

•      De novo 测序

•      序列特异DNA结合蛋白的ChIP-Seq

•      组蛋白修饰和表观遗传标记的ChIP-Seq

•      亚硫酸氢盐处理DNA的测序，DNA甲基化研究

•      宏基因组学研究

•      mRNA测序

•      基于标签的基因表达

•      小RNA测序

•      核糖体图谱分析

•      DNase I 超敏位点定位研究

•      核小体定位和染色质结构研究研究

•      CLiP-Seq：研究序列特异的蛋白-RNA相互作用研究

•      CNV-Seq：用测序测定拷贝数变异研究

•      GRO-Seq：研究RNA聚合酶起始研究

•      降解DNA样品的测序

•      末端配对mRNA测序

•      DNA印迹和等位基因特异的表达

2配置要求

2.1能符合上述指标的测序系统主机1套,包括了样本文库自动扩增和数据分析功能；仪器控制服务器配置：Intel Core i7-2710GE 2.10GHz CPU，16GB RAM，750G硬盘，采用Win7 Embedded Standard操作系统；

2.2 96孔磁力架

2.3 核酸蛋白定量仪Qubit

2.4配套控制软件；

2.5 配套分析报告软件：开展完整的数据分析无需用户干预，从质量打分的碱基检出到变异体检出和比对所需时间小于4小时；

2.6 相关仪器调试用试剂；

2.7 必需的附件、配件及专用工具等；

3.技术文件

3.1仪器操作使用手册；

3.2仪器维护的有关资料；

 工作流程

4大特性
1、最短的实验周期：从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
2、的样品制备流程：只需50ngDNA模板，2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
3、确的测序原理：MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理，数千篇高质量的国际期刊文章是对Illumina NGS平台测序结果可信度力的证明。
4、最完整的整合功能：MiSeq可以独立完成簇生成，双向测序及数据分析工作，让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。

应用范围
1、转录组测序
派森诺MiSeq测序平台是基因组已测序物种的转录组分析平台。公司技术团队目前已完成了包括斑马鱼在内的多种植物、动物的转录组测序及分析。
2、宏基因组16S rDNA单V区测序
对16s rDNA的单V区(V3/V4)进行高通量测序，鉴定细菌群和古生菌群。派森诺的技术团队使用Illumina MiSeq测序16S rDNA V4区并结合Roche 454 FLX+测序16S rDNA V1~V3区成功的对鸡的肠道环境细菌进行了鉴定。
3、Small RNA测序
1*35bp的读长地配合了小RNA的测序长度，速度快，灵敏度高。派森诺的技术团队目前已完成了鹅的小RNA测序和多种中草药的小RNA测序。

4、重测序：

包括全基因组重测序、简化基因组测序、外显子测序。
Illumina MiSeq非常适用于对微生物基因组的重测序，每次运行即可完成一个微生物基因组测序。2011年12月27日，派森诺的技术团队利用MiSeq一次运行同时完成了乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重测序，基因组覆盖深度为分别为404倍和213倍，比对至参考序列，基因组覆盖率为99%，同时检测到了多种结构变异，包括插入、缺失和SNP位点，并且检测到了全部质粒。