ABI 3730xl 遗传分析仪测序的基本原理是Sanger法。是基于毛细管电泳和荧光标记技术的DNA测序仪，拥有96道毛细管，并用荧光标记代替了Sanger法中的同位素标记，从而大大提高了DNA测序的速度和准确度。4种双脱氧核苷酸的剪辑分别用不同的荧光进行标记， 在通过毛细管时，不同长度的DNA片段上的4种荧光基团被激光激发，发出不同颜色的荧光，被CCD检测系统识别，并直接翻译成DNA序列。它运行一次可得到96条DNA序列，是目前通量的一代测序仪，也是高通量基因分析的技术平台，测序读长可达800—1000bp。
3730xl基因分析仪特点：
AppliedBiosystems推出的3730xl基因分析仪系列，代表了进行高通量、高质量测序和片段分析的新一代平台，3730xl基因分析仪整合了自动化装置和光学技术的进展，同样应用AppliedBiosystems优化的试剂和专门的软件系统，可以满足实验者日益增加的通量需求和质量需求。
3730xl基因分析仪系统的技术特点：
•双光束双侧激光激发，后置超薄CCD
•全自动上样系统
•内置条形码阅读器
•自动碱基识别与质量评分软件
•POP-7液体分离胶
•良好的温控装置提供了更大的温控范围（18~70℃）
3730xl基因分析仪用于DNA测序的主要优点：
•电泳温度可达70℃，有助于去除二级结构的影响
•良好温控装置保证片段分析准确性及重现性好
•分离胶(POP~7TMPolymer)使通常读序长度即可达800-1000bp
•新型碱基识别与质量评分软件，提高测序准确性
•毛细管内荧光检测，灵敏度高
•高灵敏度提高了测序模板DNA的浓度范围
