来自海葵 Discosoma sp. 的荧光蛋白，例如 Discosoma 红色荧光蛋白 (DsRed)。来自维多利亚水母的蘑菇或绿色荧光蛋白 (GFP) 广泛用于研究实践。融合 RFP 和 GFP 通常用作基因表达和蛋白质定位的标记。由于 DsRed 和 GFP 仅具有 19% 的同一性，因此，一般而言，抗 GFP 抗体不识别 DsRed 蛋白，反之亦然。在结构上，Discosoma 红色荧光蛋白与 Aequorea 绿色荧光蛋白在其整体折叠（β-can）和生色团形成化学方面相似。然而，Discosoma 红色荧光蛋白在发色团成熟过程中经历了一个额外的步骤，并形成了四聚体结构。Rockland 为 RFP 提供了许多对照、单克隆和多克隆抗体。
