感染性的单链RNA病毒抗原会引起像感冒，肿瘤，艾滋病等一系列威胁人类健康的疾病。病毒的复制受到几个水平的调控，其中包括保守的RNA结构的调控。病毒RNA基因组的大多数潜在的调控元件并没有明显的特点。在这里，我们运用SHAPE技术（一种高通量RNA分析技术）得出了HIV-1全RNA基因组的结构。RNA除了与蛋白质的一级结构序列相关外，RNA的结构还和HIV蛋白的结构域形成有关。这些关联说明RNA的结构调节核糖体的延伸来促使蛋白折叠。当然该RNA的结构也包括核糖体结合翻译区，聚合酶识别区和环状结构。同时我们也确定了HIV病毒RNA的剪切位点和高突变区域。这些结果指出了HIV-1的基因组及其编码RNA很有可能被一些尚未被识别的调控结构阻断，也指出了RNA的结构在基因编码中发挥着重要作用。
