抗体标记荧光染料的选择方案

蓝色（350-450nm处激发）
CF 350、Alexa Fluor 350、AMCA等----亮蓝和紫外光激发；
CF350是类似于Alexa Fluor 350和传统荧光染料AMCA的蓝色荧光染料，CF350的荧光强度高于Alexa Fluor350、AMCA , 吸附在蛋白上的荧光超过50%, 水溶性更好, 耐光性非常亮, 更容易与现有的绿色荧光基团区分；
 CF 405S/ CF 405 M、Alexa Fluor 405 ----近乎的匹配蓝色二极管激光器；
 CF 405S/ CF 405 M 、Alexa Fluor 405与近来使用的荧光显微镜和流式细胞仪405nm;谱线的蓝色二极管激光器的匹配。在流式细胞仪上的分析结果显示CF 405S/ CF 405 M荧光信号强度高于Alexa Fluor 405染料1.7倍。

绿色（488nm处激发）
CF 488A、Alexa Fluor 488、FITC、FAM、DyLight 488、Cy2等----针对488nm 氩离子激光器的绿色荧光染料；
以上染料其标记的抗体蛋白适用于所有配备488nm氩离子激光器的流式细胞仪；流式细胞仪的FL1通道检测；或者可用于荧光显微镜技术；
CF 488Azui低限度的带电量降低了与抗体耦联物的非特异性结合；在红色通道溢出少于Alexa Fluor 488；耐光性好；水溶性好和pH 不敏感；良好的稳定性和活性染料的标记率。
Alexa Fluor 488在较宽的PH值范围内保持稳定（PH4~10）；
FITC激发波长488nm，zui大发射波长525nm；缺点荧光强度易受PH值影响，PH值降低时其荧光强度减弱。

橙红色（543-555nm处激发）
CF 543、Alexa Fluor 546、ATTO550, Cy 3, DyLight 549, Rhodamine (TRITC) 匹配543nm的橙色荧光染料；细胞
CF ?543 荧光条带明亮，耐光，水溶性好，确保了CF 543染料与抗体的耦联物保持优异的水溶性，为该波段zui亮的橙色荧光染料。例如：同等的标记程度下，CF 543标记的羊抗鼠IgG抗体的亮度高于用Alexa Fluor 546 标记的2~10倍。
CF 555、Alexa Fluor 555、Tetramethylrhodamine (TAMRA) 等匹配Cy3滤光片的橙色荧光染料.