提取物中一般含有与该组分结构类似的杂质，将待测组分与杂质分别的进程，称为净化。该进程是样本前处理的技术难点，也是关系到检测结果的真实性及检测方法可靠性的重要进程。首要方法有固相萃取法、液-液分配法、化学处理法、扫集共蒸馏法、低温冷冻净化法、前置色谱柱净化法等。
固相萃取法是现在运用zui多的净化方法之一，通过吸附柱、分配柱、凝胶渗透柱、薄层板等完结，其原理是样本的待测组分在层析柱中吸附剂上被吸附与被解吸的重复进程。常用的吸附剂有佛罗里硅土、氧化铝、活性炭、硅胶、氧化镁和纤维素等。
液-液分配法也是一种十分常用的净化方法，其原理是运用待测组分在一组互不相溶的溶剂对内的分配系数不同，通过重复多次分配，使待测组分与杂质分别，以到达净化目的。常用的溶剂对有乙腈提取液的正已烷分配、乙腈提取液的分配、丙酮提取液的石油醚分配、丙酮提取液的二氯甲烷分配等。
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