表观基因组可因环境而改变*以来，人们普遍认为作为有机体发育关键步骤的甲基化只是静态地DNA修饰，不会随环境条件变化而改变。处于逆境下植物的DNA甲基化模式会发生变化，从而改变对基因的调控。羊ELISA试剂盒发现植物遭遇致病菌后，其表观遗传学密码会发生广泛的大量改变，DNA中的表观遗传学密码是协助调控基因表达一种指令信息。显示这些表观遗传学改变与负责调控植物胁迫应答的基因活性有关，这说明表观基因组能帮助植物对致病菌和其他环境胁迫产生抗性。
这意味着表观基因组并不只是一种静态指令，这种指令也能根据植物的经历进行重写，甲基化参与抑制整合到基因组中的“跳跃基因”转座子的表达。在Illumina平台上进行了全基因组测序，发现在植物应对细菌感染的过程中，出现了大量甲基化修饰的改变。随后他们进行了大量分析来分析这些甲基化改变调节基因表达的机制。
有一些基因的表达与胁迫应答中甲基化改变有关，植物的胁迫应答引发了大量的甲基化修饰改变，从而帮助植物抵御入侵的致病菌。羊ELISA试剂盒为了限制感染的致病菌生长，植物采用了一系列复杂的防御机制，激活多种激素信号来改变基因表达的网络。显示植物的这些细胞防御应答通过DNA甲基化机制控制基因表达的网络。这些遗传物质的表观遗传学改变，包括DNA甲基化模式的改变和组蛋白的修饰（组蛋白在基因调节中具有关键作用），可以不改变DNA序列而对基因表达进行调控。此外，siRNA分子与DNA甲基化密切相关，尤其siRNA指导着对跳跃基因的甲基化过程。感到惊讶的是，当植物被致病菌感染激活了特定转座子时，这些siRNA的水平也发生了改变。
