反渗透水处理系统的维护分为例行维护和异常维护。例行维护是按照一定周期定期的检查校核现场的仪器、仪表、传感器、加药泵等等长时间运行后会产生偏差的设备，通过定期标定校核，使设备均能处于良好的工作状态。
异常维护是指设备明显发生了故障，需要检修、检测或更换备品备件，异常维护具有突发性，需根据轻重缓急来安排。综合来讲，反渗透水处理系统的维护主要包括下列工作。
A．定期标准化处理运行数据，对系统的运行状态作出评估，做到早发现问题、早分析问题、 早解决问题。并就运行数据的处理和评估咨询工程公司或者膜供应商。一个RO系统的完整运行
B．定期校核在线的pH计、导电度计、压力表、流量表、温度计、ORP计、上位机时钟、泵 和风机的运行电流和发热状况等等仪器、仪表。3个月校验一次。所以用户应该对各种表计的校验校核方法充分熟悉，对设备的使用说明了然于胸，对各种可能的干扰因素也应该有所认识。
C．运行初期，定期分析反渗透水处理系统的进水水质，尤其要监测到水质的波动，掌握极限水质。这项工作对水质稳定的用户也许不重要，但对水质波动大、组分差别大的用户就变得十分重要和关键，没有准确的水质是很难采取合适的应对措施的。
D．检修、检测或更换设备时，应符合正确的操作规程，比如断水、断电、断气，参照说明书，谨慎操作，对不熟悉用途的部件不能随便丢弃等等。
维护工作进行的好坏对系统的长期可靠运行、准确监督系统的真实状况等等都十分重要。轻视维护工作，可能导致系统仪器失效失灵，进而导致运行工况严重偏离合理的范围，长此以往， 系统就可能陷入致命的故障之中，而难于恢复原有的性能。
