从经济的角度出发，或者购买不方便，或是认识上的问题等，目前我国有相当数量的液相色谱用户在使用分析纯的溶剂作流动相。采用分析纯的溶剂存在的问题是：
1分析纯试剂中的部分杂质或悬浮物会吸附在柱内的填料上，影响柱寿命；
2分析纯试剂由于杂质较多会使流动相的截止吸收波长抬高；
3由于分析纯试剂多为国产试剂，质量不稳定而且良莠不齐，给应用带来诸多不便。
但是，考虑到实际上今后仍会有大量用户使用分析纯试剂做流动相，所以下面介绍一些处理方法和注意事项。
1使用前先用气相色谱看一下纯度，有时国产试剂会以次充好，用工业品不经严格处理而直接灌装冒充分析纯。
2用不大于0.45微米的滤膜严格过滤，除去杂质和悬浮物。
3做紫外扫描，测定不同波长的吸收度，同色谱级的试剂进行比较。观察紫外吸收和截止波长是否干扰测定。
4如果是少量加入的溶剂，一般对较高波长下等度分析影响不大。
5另外，如果用于离子色谱，还要考虑无机离子的残留，国产试剂中甚至色谱纯的试剂都很少会考虑这一点。如果用于ELSD，其残留的颗粒更应注意，过多过大的颗粒会增加噪音。
6对于一些昂贵的试剂，可以采用精馏或吸附剂处理等方法精制，如用硅胶柱吸附分析纯正己烷中的芳香烃物质，减压精馏分析纯四氢呋喃除去氧化物和高紫外吸收物质。
总之，虽然有些分析纯的试剂在较高波长和质量较好时，可以满足一般色谱分析的要求，但为了延长仪器和色谱柱的寿命，建议尽量采用色谱流动相级的试剂作流动相。
