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全基因组重测序技术(WGS)

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厂商性质经销商

所  在  地深圳市

更新时间:2019-11-21 20:03:05浏览次数:2166次

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经营模式:经销商

商铺产品:7条

所在地区:广东深圳市

联系人:经理 (经理)

产品简介

全基因组重测序技术(WGS)是在已有参考序列及其基因功能注释的基础上,对相关基因组进行重测序,寻找不同个体或处理后相对于参考基因组的差异。该技术可应用于检测各种遗传突变,如单核苷酸多态性SNP、体细胞突变SNV,拷贝数变异CNV等,已经成为动植物育种、群体进化、药物研发、疾病研究和临床诊断中较为迅速而有效的方法之一,为筛选疾病的致病和易感基因,研究发病及遗传机制提供重要信息。

详细介绍

全基因组重测序技术(WGS)是在已有参考序列及其基因功能注释的基础上,对相关基因组进行重测序,寻找不同个体或处理后相对于参考基因组的差异。该技术可应用于检测各种遗传突变,如单核苷酸多态性SNP、体细胞突变SNV,拷贝数变异CNV等,已经成为动植物育种、群体进化、药物研发、疾病研究和临床诊断中较为迅速而有效的方法之一,为筛选疾病的致病和易感基因,研究发病及遗传机制提供重要信息。

全基因组重测序技术(WGS)数据解读分析内容:

  1. 标准信息分析
    • 去除接头序列、低质量序列得到clean data
    • 比对,并统计
    • *性序列生成
    • SNP检测、注释及统计
  2. InDel 检测、注释及统计
    • SV检测、注释及统计
    • CNV检测、注释及统计
    • 根据已有数据库的信息对表型或疾病风险进行评估
  3. 癌症研究的高级信息分析
    • 成对的样本(normal-tumor)SNP/InDel/SV/SNV/CNV检测、注释及统计
    • 氨基酸置换预测
    • Pathway,GO富集分析
    • 筛选出的突变与已有数据库比较(cosmic, dbSNP, HGMD等)
    • 重排检测及注释
    • 选择压力检测以识别出driver gene
    • Mutation target network

样本要求:

  1. 样品类型:无降解,无污染的DNA样品;
  2. 样品需求量:≥2μg;
  3.  样品浓度:≥50 ng/μl;
  4. 样品纯度:OD260/280=1.8~2.0


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