有几经周折反渗透。目前，膜容易产生聚集太多的细菌，“阻塞"，尽管他们已经提高，因为他们是*使用。膜恶化是用于治疗细菌。其他挫折反渗透生产的的可争议的水质量，随着盐水需要进行大量的预先处理。

　　正渗透：正向渗透利用自然渗透过程物质面积从低浓度到高浓度区。它通常需要反渗透成本的一半左右，由于使用较少的能量，以完成该过程。溶液通过一个压力梯度，而不是强迫的，这个过程允许它自然地发生。当脱盐水，海水移过一种高度浓缩的氨盐溶液的半渗透膜，在膜的另一侧离开海盐的溶液。之后，该溶液被加热，蒸发的氨盐，该盐是可重复使用的。

　　正向渗透的主要挫折的是，它有很大的潜力，但仍是相当新的大型海水淡化，因此需要资金和研究，以探讨可以改善的可能性，并降低能源成本。

　　电渗析：利用膜电渗析逆转，如反渗透，但发送的电荷，通过该溶液绘制的正极板的一侧上，而其它离子（如盐）的负极板的另一金属离子。电荷被周期性反转，以防止膜变得太受污染的，通常出现在常规电渗析。位于两板的离子可以被删除，离开背后纯水。据报道，近开发的膜耐氯，一般去除有害离子（不只是盐），比反渗透。电渗析逆转的主要挫折是创建的设施，以及能源成本的前期成本。

　　热脱盐：热脱盐是清洁水的方法，可以通过许多不同的过程发生，包括除去盐和其它污染物。所有热脱盐过程中的水加热解决方案，并收集纯净水蒸汽冷却和冷凝发生。经常用于淡化海水的两种类型是：

　　多级闪蒸：多级闪蒸再加热被加热的水的商品时，会发生多次，每次在较低的压力比上一次运作。多级闪蒸厂沿线兴建发电厂，以便使用废热。它比反渗透设备需要少得多的能量。在沙特阿拉伯使用多级闪蒸，所有的淡化水占85％左右，但也有更反渗透植物比有几个大型设施多级闪蒸植物。多级闪蒸法的主要缺点是它需要多摄入食盐水比反渗透和前期和维护成本是相当高的。

　　多效蒸馏：多效蒸馏是一个简单的过程，类似多级闪蒸。盐水溶液被加热而产生的纯净水，流入下腔。它携带的热能用来熬了一遍，产生更多的蒸汽。的是，它是用于小规模的海水淡化的主要挫折。对于大型设施的成本是非常高的。

海水淡化否定：一些常规海水淡化的过程，挫折也是存在的。放回海洋倾倒浪费盐溶液，使过程更加困难，并有可能危害海洋生物。启动和电源海水淡化厂是一个巨大的牺牲，因为大多数目前的电力来源是来自燃烧化石燃料所需要的能量，它通常是看作为只是一个问题，选择一个环境危机。在能源问题上，核能是潜在的成本效益的能源，但在很大程度上仍然未开发的，由于上有一个局部的核电厂或废物处理设施。如果位于远离海岸或在高海拔地区尝试使用淡化水，它是一个更昂贵的过程。更高的高度和远的距离需要很大的资源输送水从海洋或身体盐水。