从孔径大小看，反渗透膜的孔径极小，约为0.0001 - 0.001微米，能截留几乎所有的盐离子和分子量大于100的有机物；超滤膜孔径稍大，一般是0.001 - 0.1微米，可以截留大部分胶体、大分子有机物和细菌等，但不能截留盐离子和小分子物质。
工作压力上，反渗透膜需要较高的压力，通常在1 - 10MPa左右，才能使水克服渗透压而通过；超滤膜工作压力较低，一般在0.1 - 0.7MPa之间。
在过滤效果方面，反渗透膜的过滤精度很高，能产出几乎不含杂质的纯水，常用于海水淡化、超纯水制备；超滤膜过滤后的水还含有一些小分子物质，主要用于生活用水的初步净化，比如过滤掉水中的细菌、胶体等，保留对人体有益的矿物质。