气相色谱仪对各种气体（载气和辅助气）的纯度要求较高，气体纯度一般要≥99.99%。气源就是为气相色谱仪器提供气体的高压钢瓶或气体发生器，目前市场上有空气压缩机、氢气发生器和氮气发生器，其他气体可以使用钢瓶。在满足分析要求的前提下，尽可能选用纯度较高的气体。这样做不仅可以提高气相色谱仪的灵敏度，还能延长色谱柱、整台气相色谱仪（包括气路控制部件和气体过滤器）的寿命。高纯度的气体能够减少杂质对分析结果的影响，保证数据的准确性和可靠性。如果仪器长期使用较低纯度的气体气源，一旦要求分析低浓度、高精度要求的样品时，要想恢复仪器的高灵敏度是十分困难的。
那么我们在工作中如何保证气体使用的安全性呢？
气体中的杂质主要是一些气体、低分子有机化合物和水蒸气，分析时，主要会对分析对象、色谱柱、检测器和色谱图造成影响，影响色谱仪灵敏度和稳定性，以及结果分析，因此气体在进入仪器前要严格净化，保证仪器工作所需要的纯度。
气相色谱仪工作过程中的排空气体（隔垫吹扫气、分流放空口、检测器放空口和载气），是否要接到室外，视其对室内环境及安全的影响而定，以及可燃性气体的使用，安全考虑应该是在的。为了保证所用气体的纯化效果和使用安全，需要从气源、使用过程以及尾气排放多方面考虑。
采用什么样的气源，是用高压钢瓶还是气体发生器，要根据实际情况具体分析。如果使用氢气钢瓶，应放在室外或独立气体间以确保安全；如果实验室换气频繁或者存放不方便，推荐使用气体发生器。特别是高校实验室，很多大学明文规定禁止钢瓶进校园。使用过程中，由于空气压缩机直接压缩实验室空气，要保证气体的纯化效果，首先要保证实验室的环境清洁，有些压缩机可能会把油带入气体，因此压缩空气使用前既要除水蒸气还要除有机杂质。氢气发生器和氮气发生器，要注意所用试剂的纯度以及管路是否漏气，水蒸气是其主要杂质。
为除去气体中的杂质，要在气源和仪器之间连接净化装置。如分子筛或活性炭吸附除去低分子有机化合物，用变色硅胶除去水蒸气。净化用的分子筛、活性炭和硅胶，经过一定时间后，要注意检查和更换，更换后的填料可以重新活化继续使用，但是要注意除去填料中的粉末，避免堵塞气路。
为保证气体的使用安全，还需要考虑废气（放空气体）的排放安全。如隔垫吹扫气、分流放空口和检测器放空口等管路应尽量接到室外（使用氢气为载气时，则必须接到室外），避免有毒有害物质污染室内空气，危害操作人员健康，同时也考虑氢气作载气时的安全问题。
