目前在上，很多重要的疾病诊断标志物均使用酶联免疫测定方法来检测，如抗HAV IgM，乙肝“两对半"、抗HCV，抗HIV，ELISA试剂盒梅毒抗体、优生优育TORCH系列、性病病原体的抗原或抗体等传染性病原体血清标志物、激素、肿瘤标志物、自身抗体、特种蛋白、细胞因子和治疗药物以及HBVDNA，HCV-RNA，遗传病基因、肿瘤基因、基因突变等，这些标志物直接关系到患者的诊断和治疗。从理论上说，一种生物或生理活性物质，只要有办法得到其特异的抗体，就可以建立这种物质的酶联免疫测定方法。
在以前看来一些难以进行质量测定的微量生物活性物质。ELISA试剂盒的测定方法是以抗原抗体间的特异反应为基础的，其与生化的化学反应有着本质的区别，并且由于标记物如同位素、酶、荧光素、微量元素、发光物质等的掺人，酶联免疫测定技术从低灵敏的免疫沉淀和免疫凝集反应进入到了高灵敏的放射免疫、酶免疫、荧光免疫和发光免疫测定时代，可见酶联免疫测定更多的是用于生物活性物质的微量测定。
而在血站，HBsAg，抗HCV，抗HIV和梅毒抗体等标志物的检测，哪怕是1％的错误，对将要接受输血的特定患者来说，ELISA试剂盒就是100％的灾难。近期，在电视、报纸等新闻媒体中，常可见到一些有关医患纠纷的报道，其中一些就与酶联免疫测定有关，如输血后丙肝病毒、艾滋病毒感染的发生，性病检测的假阳性等。
