标准的PCR过程分为三步(如图所示):
<img alt="PCR步骤" pcr步骤"="" border="1" height="199" data-cke-saved-src="http://www.bio1000.com/uploads/allimg/120504/1059292160-0.jpg" src="http://www.bio1000.com/uploads/allimg/120504/1059292160-0.jpg" width="141" style="vertical-align: middle; border: 0px;">
1.DNA变性(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,
氢键断裂,形成单链DNA
2.退火(复性)(40℃-65℃):系统温度降低,引物与
DNA模板结合,形成局部双链。
3.延伸(68℃-75℃):在taq酶(在72℃左右*的活
性)的作用下,以dNTP为原料,从引物的5′端→3′ 端延
伸,合成与模板互补的DNA链。
每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量既增加一倍。
现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是*也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度。
循环参数
1、预变性(Initial denaturation).
模板DNA*变性对PCR能否成功至关重要,一般95℃加热3-5分钟。
2、引物退火(primer annealing)
退火温度一般需要凭实验(经验)决定。
退火温度对PCR的特异性有较大影响。
3、引物延伸
引物延伸一般在72℃进行(Taq酶zui适温度)。
延伸时间随扩增片段长短及所使用Taq酶的扩增效率而定。
4、循环中的变性步骤
循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列*变性:
变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不*,易造成扩增失败。
5、循环数
大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。
6、zui后延伸
在zui后一个循环后,反应在72℃维持5-15分钟.使引物延伸*,并使单链产物退火成双链。
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