在基因工程中, DNA 分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的 DNA 序列,在一定的条件下切断双链 DNA 。限制性内切酶的作用效率是受多方面因素影响的,如反应温度,缓冲体系,离子种类与浓度, DNA 的纯度和甲基化程度等。对 DNA 进行酶切时,首先要选择适合的缓冲液。对于单酶切,应选用该酶的zui适缓冲液;对于双酶切或三酶切,应选用一种能使所有酶都充分作用的缓冲液。 DNA 的纯度对于酶切的效果的影响也很大,因为蛋白质。酚。氯仿。 SDS 等杂质都会抑制限制性内切酶的活性。
琼脂糖凝胶电泳是分离,鉴定和纯化 DNA 片段的常规方法。利用低浓度的荧光嵌入染料 - 溴化乙锭进行染色,可确定 DNA 在凝胶中的位置。如有必要,还可以从凝胶中 回收 DNA 条带,用于各种克隆操作。琼脂糖凝胶的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长度为 200bp 至近 50kbp 的 DNA 。长度 100kb 或更大的 DNA ,可以通过电场方向呈周期性变化的脉冲电场凝胶电泳进行分离。
在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用。它通常采用水平电泳装置,在强度和方向恒定的电场下进行电泳。 DNA 分子在凝胶缓冲液(一般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。 DNA 分子迁移的速率受分子大小,构象。电场强度和方向,碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。
三 . 实验材料和试剂:
1. 菌种: 含 pUC18 的大肠杆菌 JM107 菌株。
2. 化学试剂和溶液
(1) LB 培养基:
NaCl 10g/l 酵母提取物 5g/l
胰蛋白胨 10g/l 氨苄青霉素 50 μ g/ml (培养基灭菌后加入)
pH7.0
(2) 70% 乙醇( -20 ℃)及无水乙醇( -20 ℃)
(3) STET 缓冲液( pH8.0 )( 8% 蔗糖, 0.5%Triton, 50mmol/L EDTA,,10mmol/L Tris )
(4) 5%CTAB (十六烷基*基溴化氨)
(5) 1.2M 氯化钠
(6) TE 缓冲液( 10mmol/L Tris-HCl, 1mmol/L EDTA )
(7) 电泳缓冲液( 50XTAE )
Tris 242g, 冰醋酸 57.1ml,EDTA(0.5mol/LpH8.0) 100ml
使用时用蒸馏水稀释 50 倍。
(8) 样品缓冲液( 6X )
0.25% 溴酚蓝, 0.25% 二甲苯青, 40% ( W/V )蔗糖
(9) 溴化乙锭 10mg/ml
(10) 琼脂糖(电泳级)
(11) 限制性内切酶
(12) 溶菌酶( 50mg/ml ,溶于 10mmol/L Tris-HCl , pH 8.0 )
3.仪器设备:
台式离心机、超净工作台、高压灭菌锅、恒温振荡培养箱、恒温水浴箱等。
Eppendorf 离心管, Tip 头,三角瓶等灭菌备用。
电泳仪,电泳槽,样品梳,微波炉,水浴锅,移液器( 20ul, 200ul 和 1000ul ),离心管, Tips(200ul,1000ul) 。
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