半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）是我国重要的商业养殖鱼类之一。当前，C. semilaevisis的培养受到了严重的细菌和病原体威胁。弧菌病是zui常见的鱼类细菌感染，能引起鱼类包括C. semilaevisis的严重病害，而鳗弧菌（Vibrio anguillarum）是该疾病的主要诱因。microRNA（miRNA）作为一类重要的非编码RNA，在多种生物过程包括免疫应答中发挥重要的调控作用。然而，目前尚没有关于miRNA在C. semilaevisis中参与病菌免疫应答的研究报道。为此，研究员利用ELISA试剂盒测序技术对C. semilaevisis在病菌侵染下的miRNA谱进行了全面分析。
研究人员首先从V. anguillarum侵染前后的C. semilaevisis的免疫组织（肝脏，头肾，脾，肠）中构建了3个小RNA文库，一个文库来自V. anguillarum未侵染的对照组（简称CG）。研究人员分别从上述3个文库中获取了11216875条，12313404条，和11398695条Clean Reads。生物信息学分析共鉴定出452个miRNAs，包括24个新的miRNAs。接着，研究人员对不同文库间差异表达的miRNAs进行了分析。在NOSG-CG比较中，有175个miRNAs（38.72%）存在显著差异表达。在HOSG-CG比较中，有215个miRNAs（47.57%）发生显著差异表达。相比于CG，进行HOSG-NOSG比较时，发现有122个miRNAs（26.99%）发生显著差异表达。采用ELISA试剂盒实时定量PCR对选取的10个miRNAs进行了验证，获得了与测序一致的结果。进一步对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG通路分析，结果表明存在一组高丰度表达且在不同条件下显著差异表达的miRNAs可能参与了免疫系统的发育和免疫应答。
