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野外型高通量植物表型平台——Field Scanalyzer

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具体成交价以合同协议为准
  • 公司名称上海泽泉科技股份有限公司
  • 品       牌
  • 型       号
  • 所  在  地上海
  • 厂商性质其他
  • 更新时间2025/5/12 11:27:54
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上海泽泉科技股份有限公司(Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.)成立于2000年,是一家专注于科研设备研发、系统集成、技术推广、咨询、销售和、科研服务的。公司注册资金3500万元人民币,具有进出口贸易权。公司总部位于上海浦西,在北京设有分公司,在广州、成都、武汉分别设有代表处。公司全体员工均具有高等教育背景,其中80%的技术研发、技术支持和销售人员具有硕士和博士学位,参加过很多国家和省部级重大科研项目,具有丰富的科研工作经验。上海泽泉科技股份有限公司是上海市、上海市普陀区科技小巨人企业、上海市科技型企业、中华全国合会/上海市合会/上海市商会会员单位,还是上海市专业技术服务平台——生理生态测量与分析平台的依托单位和上海市*成果转化项目承担单位。2012年公司通过了ISO9001质量管理体系认证,获得AA信用资质等级认定,获得普陀区科技小巨人企业认定,成为上海市研发公共服务平台加盟单位和“上海市合会”/“上海市商会”会员单位 。2015年获得“专精特新”中小企业认定。2016年成为“上海市生态学学会常务理事单位” ,和“上海种子行业协会”会员单位。上海泽泉科技股份有限公司非常注重自主知识产权的申报和保护,截止2017年初已获得发明9项、实用新型33项及软件著作8项,国内外科研期刊发表科研论文20多篇。公司还参与承担了国家自然科学基金重点项目(41030529)和948项目(200907)。公司秉承推进中国生态环境改善、农业兴国的理念,服务涉及植物表型组学和基因组学、植物生理生态、土壤、环境气象、水文水利、氢农业等领域的科研和技术支持,服务对象主要为各级科研单位、高校和政府机构。公司先后为“973”项目和“863”项目、国家科技重大专项、国家科技支撑计划、国家“211”工程和“985”工程、中科院知识创新工程、“948”项目、“948”项目等提供技术咨询、仪器设备、系统解决方案和系统集成服务,为项目的顺利完成提供了有力支持。多年来,公司积极参与相关领域的学术会议,并定期举办相关仪器设备的技术讲座和培训班,在科研和监测领域产生了积极的反响,获得了良好的口碑。截止2019年底,泽泉科技举办公开技术讲座230场,参会人员超过10000人次;同时在国内外应邀参加学术会议和展会220次,与相关领域的客户有非常密切的交流合作。2014年2月,上海泽泉科技股份有限公司在上海浦东孙桥现代农业园区投资成立了上海乾菲诺农业科技有限公司,建设了亚洲AgriPhenoTM“高通量植物基因型-表型-育种服务平台”,为植物科研和育种单位提供全面的样品收集和栽培,实验设计和项目合作,以及表型数据与生物信息学分析综合服务。平台运营至今,成功主持了上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重点项目“泽泉科技高通量植物基因型-表型-育种服务平台”。作为主持单位或合作单位参与了上海市农委和科委的30多项政府科研服务项目以及商业服务项目,如科技兴农种业发展项目“农作物分子育种的技术创新研究”和“青菜高通量表型图谱标准的建立及主要性状分析”、科技兴农重点攻关项目“基于图像分析及三维建模技术的黄瓜长势快速评价方法研究”、 “兰科观赏花卉分子育种技术研究与产业化应用”等。结合Agripheno平台现有实验室、温室栽培和基础科研条件,公司积极响应上海市政府“崇明生态岛建设”的发展方向,2016年12月泽泉科技在崇明城桥镇投资成立了子公司—上海金盏农业发展有限公司,扩展建设田间智能化育种服务平台,以及智能化农业物联网“农业云平台”,以生态乡村、能源乡村的发展模式,展示并实施公司自主研发的*的农业楼宇基础设施、温室与田间的智能化“多因子”调控的栽培管理模式;拟建成拥有田间型高通量表型分析系统的“Agripheno智能化育种服务平台”,提高上海种业商业化育种的进程,并服务于全国和国外相关育种科研单位。 展望未来,上海泽泉科技股份有限公司希望在社会多方资源的支持和关怀下,不断提升自己,为社会提供更多、更优秀的产品和的服务!
1自动化FieldSystem系统ScanalyzerField是利用门式起重系统二设计和组建的3轴表型系统,X轴方向的运动是通过轨道系统进入地面,以允许自然排水和无障碍运行,如传统的混凝土地基可以充当流动屏障,Y轴垂直于轨道,并且承担摄像机设置的升降装置,Z轴描述的是升降单元上下移动的方向
野外型高通量植物表型平台——Field Scanalyzer 产品信息

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1  自动化 FieldSystem 系统

Scanalyzer Field 是利用门式起重系统二设计和组建的3轴表型系统,X轴方向的运动是通过轨道系统进入地面,以允许自然排水和无障碍运行,如传统的混凝土地基可以充当流动屏障,Y轴垂直于轨道,并且承担摄像机设置的升降装置,Z轴描述的是升降单元上下移动的方向。

X轴运动单元是由两个变频有源电源和两个无源单元,将被绑定在支撑梁上,Y轴包括门式框架(铝),并将保护Z轴的运动,Scanalyzer Field 系统的推进包括两个电动逆变器供电引擎,驱动底部两个齿轮传输,Y轴和Z轴同样是由电动逆变器和齿条一起供应运转。

这样的设置可以使系统精密的在X、Y和Z轴上运动。

Scanalyzer Field 系统上的运行部件均来自其他手动或自动操作的系统,比如船舶和火车卸货等,因此Scanalyzer Field 系统的零件具有更耐久性和灵活性。

 

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图1: ScanalyzerField系统示意图

 

1.1 系统参数

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1.2  系统操作注意事项

开始的时候,接受过培训的人员利用远程操作进行系统的运行;

每个试验地的开始和结束位置,本步骤在每一个试验开始前进行,在播种前就要做好;

一旦实验设置被保存,用户需要使用控制软件选取接下来的参数,参数包括时间、频率、地点等;

保证所有的图像之间都有重复,保证每一个植株都会被测量到;

荧光测量时,如果是在晚上,要充分考虑到荧光对周围植株的影响,不能紧接着进行测量。

1.3  系统精确度

ScanalyzerField 系统的精度可以达到X轴<±50mm,Y轴<±5mm和Z轴<±5mm,除GPS定位外,每张照片都包含在ScanalyzerField系统三维空间的位置。

1.4  系统耐久性

因为所有的部件都采用工业标准,加载的重量远远低于设计时的承重能力,ScanalyzerField 系统可以持续使用5年以上的时间。

1.5  系统维护

尽管相机朝下且有保护附件,但是为了保证成像质量,常规的清洁仍是必要的,如果下大雨,有必要清洁一下相机的外壳,清除残余的水和残渣。

在植物的生长季,如果ScanalyzerField 系统每天都要工作,那么每年进行一次检查和预防性维护是非常必要的。

维护包括检查所有滑动部件的润滑性,也要对成像传感器进行检测,在仪器运行的前三年,不会跟换新的部件。

1.6  系统安全方案

1.6.1  ScanalyzerField系统常见风险

自动模式:

系统自动运行时,人员不能站在ScanalyzerField系统轨道间的任何区域;

ScanalyzerField系统会按照编辑的程序沿轨道进行运动,任何站在系统上方或离轨道较近的人员,都会有与ScanalyzerField系统碰撞的危险,系统自动运动的速度可达60min/min;

自动运行模式下,图像采集臂可以在2米以下高度移动;

荧光成像技术使用短LED脉冲(1-2s),亮度相当于太阳光的4-6倍;

高度扫描设备包括可见激光。

手动模式:

手动模式下,操作者就会在运行系统的周边,并且成像时,操作者需要与系统直接接触;

系统不运行的情况下,传感器的盖子被打开,所有的安全模块开启且显示危险警告。

1.6.2  ScanalyzerField系统风险应对

技术性

导轨放在土层以上,减少人员站在导轨上的风险;

ScanalyzerField系统会产生声音和灯光信号,提醒周围的工作人员;

ScanalyzerField系统的导轨如果碰到物体,不论在手动状态或自动状态,紧急开关会将ScanalyzerField系统紧急停止,

安全保险不能使用,因此系统有大约1m左右的断裂长度。

人工控制ScanalyzerField系统时,可以使用紧急暂停按钮。

人工操作时,ScanalyzerField系统运行时的速度是有限制的。

当人工操作系统时,激光和荧光的光源是停用的。

当遇到恶劣环境时,自动运行模式不能维持,ScanalyzerField系统会进入安全位置。

1.6.3  系统组织培训

ScanalyzerField系统的操作者会接受单独培训。

系统维护人员需要较好掌握技术教育,并且接受ScanalyzerField系统的培训。

整个ScanalyzerField系统的外侧都应安装有2m高的栅栏,并且进入栅栏区域的应该是接受过培训的人,入口处应该粘贴安全条例。

 

2  传感器平台

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图 2: 传感器平台概念图(最终版本可能有所不同)

 

每一种相机系统都单独安装在密封壳体内,并绑定在灵活可调的成像盒中,照相机箱的总有效载荷可以达到500公斤,允许灵活的增加传感器。

主要特点:

天气保护平台,单独保护传感器;

卷帘门在平台下面的对面,充分保护不在使用的传感器;

夜间使用的卤素灯同时具有加热元件,可以防止传感器温度过低而表面水分凝结。

大小:

3m 宽

1.5m 高

1.5m 深度

载重:

500kg

 

2.1 FLIR 红外相机

相机与样品距离、大气温度、相对湿度等环境参数对测量结果影响很大,因此定期的重校准很有必要。

结合前景/背景分离,可以提取出不同植物的精确温度,温度的高低将以假色图像的形式表现出来,从而更容易观察到颜色的变化,红外传感器所得到的数据可以以柱状图的形式表现出来,从而分析植物的温度分布。

成像和光学参数

焦距                            

空间分辨率(IFOV)

镜头识别

焦距比数

热敏度/NETD

像频 (SC645) 

像频 (SC 665) 

聚焦                                     


24.5 mm (0.96 in.)

0.69 mrad

自动

1.0

< 0.05°C ,+30°C下 (+86°F) / 50 mK

25 Hz

50 Hz (100/200 Hz 和开窗)

自动或手动 (内装电动机)

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2.2 RGB 相机 

界面        

分辨率

传感器

传感器类型

传感器尺寸

电池尺寸

透镜支架

A/D

On-board FIFO

IEEE 802.3 1000baseT   

3296 x 2472 

Truesense KAI-08050  

CCD 渐进

4/3式

5.5 µm

F-Mount

14 bit

128 MB

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2.3 高光谱传感器

表1 : 文献中发表的高光谱指数

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彩色条显示的是某些指数所需要的光谱范围,绿色和黄色条可以通过VNIR相机成像(380-1000nm),黄色和红色条可以通过VNIR相机(550-1700nm),近红外相机不包含900nm以下的范围,对于SWIR相机,已知的参数主要在纤维素和木质素相关的参数。

为了弥补不断变化的现场光线,补偿性设备会提供适量的光源,附加光源为卤素灯,并且范围在500到2500纳米。

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图3: 附加光源的亮度


2.4 激光扫描器

从上部观察的高度扫描仪是Frauenhofer IIS研究机构专门为Lemna Tec公司开发。

使用NIR激光扫描器可以避免影响植物的正常生理,使用非常高的分辨率和很小的时间间隔。

顶部视图时,两个单元将结合起来,详见图4.

两个单元的交叉可以减少树冠阴影面积的影响。

在侧面扫描时,每个侧视图由四个单元组合成一个传感器,光学元件和角度的选择将根据台架安装的设计而改变。

每一个单元都包含传感器头和电脑,将传感器信息结合到plc文件里。

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图4: 激光扫描设备从上部扫描植物冠层


2.5  用于PSII研究的荧光相机

荧光相机是使用直接荧光值,目前有一篇文献(Strasser, R. J., A. Srivastava, and M. Tsimilli-Michael. "The fluorescence transient as a tool to characterize and screen photosynthetic samples." Probing photosynthesis: mechanisms, regulation and adaptation (2000): 445-483.)解释为什么Lemna Tec会选择直接荧光测定,或被称为PAM直接荧光法:

目前使用的有两种荧光技术,直接荧光和调制荧光技术,每一种技术都有优势和缺陷,随着技术的发展,光电池和光电倍增管的低灵敏度要求高的激发光的强度,这样使用直接荧光的方法是比较好的,但是有两个缺点:(a)强大的激发光会引起一个快速的荧光上升;(b)快门开放的时间过长(大约1ms),Fo值无法测定。敏感的光电池,光电二极管和高性能放大器的发展,使得荧光信号的测量具有非常低的激发光的强度,低强度调制光束激发衡量荧光,初始和荧光都可以进行测量,并且精度很高,但是仍有两个限制:(a)该时间分辨率由调制和解调频率的限制;(b)一种低成本调制荧光计以10微秒的时间12位信号的分辨率不可以实现。如PEA荧光仪,它耗电少且成本低,高分辨率荧光上升允许人们观察几个步骤,F0,K,J,I,P,缺点是需要外界光源,目前,直接荧光法比调制荧光法有一些优势,如每次测量的信息更多、低功耗、高采样检测率、重量轻、多种环境下采集数据和成本低。


表2: 仪器可以测量的荧光参数

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注:DA:测量暗适应后的参数,在测量以前,ScanalyzerField系统会保留暗适应的时间,在测量下一个植株之前,为避免前个植株的影响,这样的测量要在晚上进行。

LA:所有需要光适应的参数都是在白天进行,因为两个不同相片的光密度有可能不同,因此标记LA的参数需要额外的处理,所有的数据才能够进行比较,同样,可以利用激发光的10%作为光化光,用户可以在测量前15分钟调整光适应。

DL:光-暗交替的参数只能是整个植株的平均值,这是因为植物的生长和叶片位置改变所造成两次测量差异。


2.6  NDVI/PRI 传感器

NDVI传感器运行一次,便可以快速对田间进行评价,NDVI传感器同时可以测量PRI,这种传感器适用于研究者研究整个田间的参数,而不是单一的植株。

NDVI 波段:  630±5 和 800±5 nm 峰值波长, 50纳米和40纳米的全宽度半值(FWHM)频带宽度。

PRI 波段:     531±3 和570±3 nm 峰值波长, 10纳米全宽度半值(FWHM)频带宽度。

前部光学:

半球形:余弦校正聚四氟乙烯扩散器,市场为半球形;

视场光阑:20°市场。

校准:NIST可溯源校准到已知的光谱福照度(W m-2 nm-1)或辐射率(W m-2 nm-1 sr-1 )

精度: 光谱辐照度和辐射值在10%或更高

测量时间:< 300 ms

外形尺寸: 43 x 40 x 27mm


2.7  主动反射传感器


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作物冠层传感器Crop Circle ACS-430提供经典的植物指数数据(NDVI和SRI等),以及来自植物冠层和土壤的基本反射信息。

与被动传感器不同,Crop Circle ACS-430不会受外界光强的限制,测量可以在白天或夜间进行。

Crop Circle ACS-430传感器可以安装到各种类型的车辆上,并且进行田间测量,紧凑的尺寸和低重量的设计使Crop Circle ACS-430可以很容易地适应支杆安装和手持式应用。传感器产生的信息可以被用于定量的营养物质、水、疾病或其他生长条件对植物或作物的影响。

多通道光谱测量

ACS-430有三个可选的测量频道,传感器同时测量植物/土壤在670nm/730nm/780nm处的反射值,ACS-430传感器的主要特点是测量时与高度无关,Holland Scientific把这种反射测量称作Pseudo Solar Reflectances (PSR)。因此光谱反射值会因为传感器的高度而改变,因此不使用比例计算,就可以获得数十个参数。(来源于: -canopy -sensor/)


2.8 环境传感器 

2.8.1  天气传感器

CLIMA SENSOR US NHTFB(超声波)传感器可以实现免维护,且没有可动磨损部件,如或轴承等。

本系统可连接例如风速、风向、声学虚拟温度、空气温度、相对空气湿度、亮度、空气压力、降雨量等传感器,用于环境参数的收集。


2.9  常规传感器

本系统可加载PAR传感器、二氧化碳传感器等。


德国IPK安装的Rhizotrone根系分析系统,由德国LemnaTec设计、德国MK公司施工建设。相关视频,请点击:德国IPK安装的Rhizotrone根系分析系统。


产地:德国LemnaTec

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