1、高压差导致脱盐率下降
压差升高同时往往伴随着脱盐率快速下降。在正常的流量下，压差的上升通常是由于膜元件水流量通道的隔网进入杂质，污染物质和水垢引起的，导致产水流量的下降。
当超过设定的给水流量时，也会发生过大的压差，当启动时给水压力提升过快，发生水锤压差会很大，如果膜已经被污染，特别是微生物污染，压差也会增大。给水至浓水间的压差表示的是水力阻力，与给水的流速、温度有关，应该保持产水和浓水有一定的流速。出现高压差的可能性有：水垢、微生物污染、阻垢剂沉淀、过滤器过滤介质漏、给水/浓水密封损坏。
2、在线化学清洗不合理
超纯水设备在运行中是不可避免被污染。预处理和添加各种药剂只能将反渗透被污染的可能性降到而不能杜绝。因此，长期运行的反渗透系统在经过一定时间的运行后，必须要充分论证和确认是哪一种污染物。针对聚酰胺膜的特点，可以根据相应的污垢选取适当的清洗剂：
a
盐酸(36%-38%)，配制成0.12%稀溶液，去除金属氧化物质。
b
*，配制成0.1%的稀溶液，去除二氧化硅、微生物膜、有机物等，pH约为12。作用是对有机微生物粘膜的水解破坏而剥离，对于二氧化硅胶体垢，形成的硅酸钠为可溶性，从而除垢。
c
乙二胺四乙酸四钠，作为螯合剂广泛应用于工业清洗，1%水溶液pH10.5-11.5，加入浓度0.5%-1%。
d
十二烷基磺酸钠，属阴离子表面活性剂，目的是分散在溶液中的有机化合物，可使溶液的表面张力降低，引起正吸附，这样可使溶液表面溶质分子的的浓度大于溶液内部溶质分子的浓度。十二烷基磺酸钠是反渗透清洗是最主要的表面活性剂，加入浓度为0.025%。
e
甲醛，甲醛对细菌、真菌、病毒、芽胞及原虫等皆有的杀灭力，加入浓度为0.5%-35。
